Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC97Q96F63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC97Q96F63 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC97Q96F63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms