Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TVP23CQ96ET8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms