Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM5Q96DZ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CMTM5Q96DZ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM5Q96DZ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms