Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHISA4Q96DD7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHISA4Q96DD7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHISA4Q96DD7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHISA4Q96DD7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms