Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REPS1Q96D71 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
REPS1Q96D71 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REPS1Q96D71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms