Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDF1Q96CC6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHBDF1Q96CC6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms