Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VTI1AQ96AJ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VTI1AQ96AJ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VTI1AQ96AJ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VTI1AQ96AJ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms