Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN3Q969G5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN3Q969G5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN3Q969G5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN3Q969G5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms