Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HGDQ93099 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HGDQ93099 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HGDQ93099 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HGDQ93099 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGDQ93099 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGDQ93099 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGDQ93099 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGDQ93099 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HGDQ93099 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGDQ93099 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGDQ93099 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGDQ93099 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HGDQ93099 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HGDQ93099 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HGDQ93099 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HGDQ93099 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HGDQ93099 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HGDQ93099 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HGDQ93099 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HGDQ93099 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HGDQ93099 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HGDQ93099 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HGDQ93099 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HGDQ93099 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HGDQ93099 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HGDQ93099 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HGDQ93099 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HGDQ93099 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HGDQ93099 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HGDQ93099 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HGDQ93099 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HGDQ93099 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HGDQ93099 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HGDQ93099 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HGDQ93099 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HGDQ93099 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HGDQ93099 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HGDQ93099 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HGDQ93099 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HGDQ93099 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HGDQ93099 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HGDQ93099 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HGDQ93099 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HGDQ93099 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HGDQ93099 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HGDQ93099 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HGDQ93099 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HGDQ93099 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HGDQ93099 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HGDQ93099 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HGDQ93099 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HGDQ93099 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HGDQ93099 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HGDQ93099 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HGDQ93099 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HGDQ93099 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HGDQ93099 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HGDQ93099 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HGDQ93099 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HGDQ93099 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HGDQ93099 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HGDQ93099 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HGDQ93099 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HGDQ93099 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HGDQ93099 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HGDQ93099 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HGDQ93099 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HGDQ93099 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HGDQ93099 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HGDQ93099 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HGDQ93099 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HGDQ93099 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HGDQ93099 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HGDQ93099 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HGDQ93099 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HGDQ93099 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HGDQ93099 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HGDQ93099 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HGDQ93099 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HGDQ93099 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms