Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP7Q93009 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP7Q93009 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP7Q93009 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP7Q93009 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP7Q93009 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP7Q93009 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP7Q93009 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP7Q93009 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP7Q93009 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP7Q93009 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP7Q93009 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP7Q93009 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP7Q93009 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP7Q93009 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP7Q93009 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP7Q93009 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP7Q93009 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP7Q93009 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP7Q93009 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP7Q93009 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP7Q93009 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP7Q93009 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP7Q93009 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP7Q93009 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP7Q93009 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP7Q93009 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP7Q93009 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP7Q93009 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP7Q93009 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP7Q93009 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP7Q93009 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP7Q93009 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP7Q93009 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP7Q93009 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP7Q93009 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP7Q93009 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP7Q93009 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP7Q93009 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP7Q93009 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP7Q93009 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP7Q93009 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP7Q93009 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP7Q93009 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP7Q93009 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP7Q93009 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP7Q93009 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP7Q93009 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP7Q93009 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP7Q93009 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP7Q93009 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP7Q93009 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP7Q93009 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP7Q93009 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP7Q93009 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP7Q93009 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP7Q93009 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP7Q93009 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP7Q93009 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP7Q93009 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP7Q93009 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP7Q93009 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP7Q93009 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP7Q93009 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP7Q93009 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP7Q93009 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP7Q93009 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP7Q93009 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP7Q93009 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP7Q93009 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP7Q93009 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP7Q93009 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP7Q93009 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP7Q93009 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms