Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP13Q92995 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP13Q92995 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP13Q92995 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP13Q92995 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP13Q92995 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP13Q92995 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP13Q92995 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP13Q92995 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP13Q92995 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP13Q92995 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP13Q92995 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP13Q92995 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP13Q92995 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP13Q92995 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP13Q92995 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP13Q92995 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP13Q92995 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP13Q92995 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP13Q92995 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP13Q92995 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP13Q92995 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP13Q92995 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP13Q92995 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP13Q92995 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP13Q92995 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP13Q92995 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP13Q92995 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP13Q92995 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP13Q92995 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP13Q92995 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP13Q92995 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP13Q92995 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP13Q92995 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP13Q92995 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP13Q92995 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP13Q92995 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP13Q92995 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP13Q92995 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP13Q92995 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP13Q92995 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP13Q92995 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP13Q92995 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP13Q92995 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP13Q92995 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP13Q92995 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP13Q92995 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP13Q92995 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP13Q92995 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP13Q92995 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP13Q92995 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP13Q92995 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP13Q92995 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP13Q92995 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP13Q92995 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP13Q92995 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP13Q92995 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP13Q92995 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP13Q92995 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP13Q92995 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP13Q92995 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP13Q92995 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP13Q92995 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP13Q92995 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP13Q92995 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP13Q92995 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP13Q92995 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP13Q92995 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP13Q92995 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP13Q92995 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP13Q92995 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP13Q92995 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP13Q92995 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP13Q92995 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP13Q92995 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP13Q92995 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP13Q92995 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP13Q92995 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP13Q92995 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP13Q92995 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP13Q92995 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP13Q92995 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP13Q92995 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP13Q92995 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP13Q92995 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP13Q92995 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP13Q92995 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP13Q92995 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP13Q92995 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP13Q92995 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP13Q92995 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP13Q92995 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.3 ms