Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX13Q92968 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX13Q92968 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX13Q92968 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX13Q92968 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX13Q92968 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms