Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NEO1Q92859 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEO1Q92859 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEO1Q92859 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NEO1Q92859 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEO1Q92859 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NEO1Q92859 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NEO1Q92859 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEO1Q92859 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NEO1Q92859 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms