Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms