Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL2Q92772 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL2Q92772 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms