Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF4BQ92750 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF4BQ92750 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF4BQ92750 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF4BQ92750 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms