Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113Q902F9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HERVK_113Q902F9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HERVK_113Q902F9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HERVK_113Q902F9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms