Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GIPC3Q8TF64 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC3Q8TF64 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms