Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 SEL1L3-211ENST00000513691 605 ntTSL 213.96□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 BCR-207ENST00000463770 168 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 PLEKHO1-206ENST00000485470 638 ntTSL 213.83□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-213ENST00000576453 539 ntTSL 513.72□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-209ENST00000573352 564 ntTSL 413.61□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-211ENST00000574784 590 ntTSL 413.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FAN1-206ENST00000565280 4999 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-203ENST00000464499 4439 ntTSL 213.33□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ANKS6-203ENST00000444472 2272 ntTSL 213.28□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ZNF341-204ENST00000493497 3240 ntTSL 213.15□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ZNF341-203ENST00000483118 3232 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.316e-19■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-204ENST00000420829 582 ntTSL 413.1□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMX3-205ENST00000564008 530 ntTSL 312.99□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ZNF341-205ENST00000497876 3140 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ANKS6-207ENST00000634393 2284 ntTSL 512.75□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FAN1-208ENST00000568145 851 ntTSL 312.74□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 PLEKHO1-204ENST00000477309 702 ntTSL 212.48□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 BCR-212ENST00000479188 658 ntTSL 412.42□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.466e-19■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NF2-207ENST00000397789 1857 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NF2-204ENST00000361166 1837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NF2-211ENST00000432151 1000 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NR2C2-203ENST00000406272 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.596e-19■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 LINC00662-208ENST00000591338 436 ntTSL 211.31□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TOPORS-201ENST00000360538 4098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 LINC00662-202ENST00000586248 669 ntTSL 310.96□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 PELI1-201ENST00000358912 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 XPO4-203ENST00000465018 367 ntTSL 310.87□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 AC073529.1-201ENST00000608176 1549 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 CTNNBL1-210ENST00000628103 1958 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 510.5□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SNX24-209ENST00000511545 608 ntTSL 210.48□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-208ENST00000436590 559 ntTSL 410.45□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NR2C2-208ENST00000437120 739 ntTSL 310.43□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NF2-206ENST00000361676 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 MRPS28-208ENST00000521605 437 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NR2C2-202ENST00000393102 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SP4-204ENST00000448246 4293 ntTSL 59.97□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SEL1L3-213ENST00000514872 558 ntTSL 49.97□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ANKRD46-206ENST00000520552 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMX3-207ENST00000565918 710 ntTSL 59.73□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMX3-210ENST00000569053 940 ntTSL 1 (best)9.73□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.866e-13■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FUK-212ENST00000576107 756 ntTSL 39.64□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TRAP1-206ENST00000571538 587 ntTSL 49.37□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-209ENST00000440350 617 ntTSL 39.35□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 AC078814.1-201ENST00000484568 645 ntBASIC9.22□□□□□ -0.936e-13■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 BBS7-201ENST00000264499 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ARID4A-201ENST00000348476 5562 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-214ENST00000617389 3259 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 38.4□□□□□ -1.065e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 AC073529.1-204ENST00000608916 567 ntTSL 48.23□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 LINC00662-207ENST00000590677 883 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 PLEKHO1-209ENST00000607609 3741 ntTSL 27.98□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 CTNNBL1-207ENST00000473857 2990 ntTSL 27.94□□□□□ -1.145e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.145e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 MRPS28-207ENST00000521434 585 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)7.76□□□□□ -1.175e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 LINC00662-203ENST00000586954 2254 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.175e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 AC073529.1-203ENST00000433747 1071 ntTSL 1 (best)7.54□□□□□ -1.25e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.245e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMX3-204ENST00000562706 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.245e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 LMBR1-218ENST00000486837 576 ntTSL 27.1□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 SNX24-208ENST00000511211 566 ntTSL 37.07□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 TMCO3-204ENST00000462877 491 ntTSL 27.01□□□□□ -1.295e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 MRPS28-205ENST00000519386 555 ntTSL 26.91□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 56.64□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 65.9
PUM2Q8TB72 GKAP1-201ENST00000376362 1237 ntTSL 1 (best)6.53□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 65.9
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 626.7 ms