Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB33

LINC01560, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01560, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01560Q8TB33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01560Q8TB33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC01560Q8TB33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms