Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATL2Q8NHH9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL2Q8NHH9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL2Q8NHH9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms