Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNL1Q8NG31 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNL1Q8NG31 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.6 ms