Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HELBQ8NG08 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
HELBQ8NG08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HELBQ8NG08 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HELBQ8NG08 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms