Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND71

GIMAP8, GTPase IMAP family member 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMAP8Q8ND71 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GIMAP8Q8ND71 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GIMAP8Q8ND71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GIMAP8Q8ND71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIMAP8Q8ND71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIMAP8Q8ND71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIMAP8Q8ND71 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIMAP8Q8ND71 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIMAP8Q8ND71 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIMAP8Q8ND71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIMAP8Q8ND71 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIMAP8Q8ND71 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms