Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC150Q8NCX0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC150Q8NCX0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC150Q8NCX0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC150Q8NCX0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC150Q8NCX0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms