Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC197Q8NCU1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC197Q8NCU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms