Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN22Q8N7P3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN22Q8N7P3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN22Q8N7P3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms