Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC155Q8N6L0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC155Q8N6L0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms