Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDR16C5Q8N3Y7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR16C5Q8N3Y7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDR16C5Q8N3Y7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR16C5Q8N3Y7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR16C5Q8N3Y7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms