Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 215.08■□□□□ 03e-7■■■■■ 48.8
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AGGF1Q8N302 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 48.6
AGGF1Q8N302 UBASH3A-202ENST00000319294 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 48.6
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AGGF1Q8N302 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.56e-18■■■■■ 48.4
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AGGF1Q8N302 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.976e-18■■■■■ 48.4
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AGGF1Q8N302 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.599e-14■■■■■ 47
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AGGF1Q8N302 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.312e-11■■■■■ 46.9
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AGGF1Q8N302 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.483e-11■■■■■ 46.6
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AGGF1Q8N302 SGK2-202ENST00000373077 1736 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 46.5
AGGF1Q8N302 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 46.5
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AGGF1Q8N302 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 46.2
AGGF1Q8N302 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 46.2
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AGGF1Q8N302 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 46.2
AGGF1Q8N302 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 45.9
AGGF1Q8N302 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 45.9
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AGGF1Q8N302 ANKMY1-223ENST00000489677 292 ntTSL 57.83□□□□□ -1.166e-10■■■■■ 45.7
AGGF1Q8N302 TRPM4-204ENST00000595071 2947 ntTSL 219.99■□□□□ 0.791e-11■■■■■ 45.6
AGGF1Q8N302 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 45.6
AGGF1Q8N302 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 45.6
AGGF1Q8N302 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 45.6
AGGF1Q8N302 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 45.6
AGGF1Q8N302 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC8.62□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 45.6
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