Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE1Q8N0S2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCE1Q8N0S2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE1Q8N0S2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE1Q8N0S2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms