Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL3Q8IVW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL3Q8IVW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL3Q8IVW4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms