Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FUNDC1Q8IVP5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FUNDC1Q8IVP5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms