Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
IFNL1Q8IU54 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFNL1Q8IU54 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFNL1Q8IU54 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFNL1Q8IU54 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms