Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SFR1Q86XK3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SFR1Q86XK3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFR1Q86XK3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms