Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GPBP1Q86WP2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPBP1Q86WP2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPBP1Q86WP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms