Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCA5Q86VQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCA5Q86VQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms