Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF554Q86TJ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF554Q86TJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms