Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF550Q7Z398 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF550Q7Z398 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF550Q7Z398 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms