Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX8Q7RTT4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms