Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SSX9Q7RTT3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX9Q7RTT3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX9Q7RTT3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX9Q7RTT3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms