Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTF1AQ7RTS3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTF1AQ7RTS3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTF1AQ7RTS3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTF1AQ7RTS3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms