Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.78■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
USP31Q70CQ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP31Q70CQ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP31Q70CQ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP31Q70CQ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP31Q70CQ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms