Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK10Q6ZWH5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK10Q6ZWH5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms