Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf47Q6ZRZ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf47Q6ZRZ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms