Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF493Q6ZR52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF493Q6ZR52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF493Q6ZR52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms