Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RUFY4Q6ZNE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY4Q6ZNE9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY4Q6ZNE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms