Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMV5

PPP4R3CP, Putative SMEK homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3CPQ6ZMV5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R3CPQ6ZMV5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3CPQ6ZMV5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3CPQ6ZMV5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms