Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZRN4Q6ZMN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZRN4Q6ZMN7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms