Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW12Q6X9E4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW12Q6X9E4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW12Q6X9E4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW12Q6X9E4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXW12Q6X9E4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXW12Q6X9E4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms