Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms